انطلق نادي المبرة عام 1980، وكان قوام الفريق الأول مجموعة من الطلاب الأيتام الذين ترعرعوا في مبرة الإمام الخوئي –أولى مؤسات جمعية المبرات- وأولعوا بكرة القدم فأولتهم الإدارة الرعاية والعناية وأنشأت لهم فريقاً حمل اسم "فريق مبرة الإمام الخوئي".

وقد شارك الفريق في الأنشطة المدرسية سنوات، ثم بدأ يخوض مباريات ودية مع فرق متعددة في الضاحية للاحتكاك خارج إطار الدورات المدرسية.

وفي عام 1986 وبعد خوض الفريق 45 مباراة أحصت إدارة النشاط الرياضي في المبرة تحقيق 42 فوزاً مقابل 3 خسارات فقط، وتقرر التقدم بطلب ترخيص رسمي للفريق والانتساب إلى الاتحاد اللبناني لكرة القدم، بعد هذه النتائج الإيجابية المشبعة.

نال نادي المبرة الرياضي الترخيص القانوني وانضم إلى عائلة الإتحاد اللبناني لكرة القدم عام 1987م، ومنذ ذلك الحين يشارك الفريق في البطولات الرسمية ولا يغيب عن المنافسات تحت أي ظرف من الظروف ويتطلع إلى التألق والتطور نحو الأفضل ليلعب دوراً مؤثراً وفاعلاً في الكرة اللبنانية.

وقد شارك المبرة بفاعلية في منافسات كأس لبنان والدوري العام ودورات التصنيف وقد تأهل للمرحلة النهائية للصعود للدرجة الثانية مرتين دون أن يحالفه الحظ. وأحرز موسم 1990 – 1991 بطولة في محافظة جبل لبنان وانتزع موسم 1991 – 1992 التعادل من الهومنمن 1 – 1 بعد التمديد في كأس لبنان قبل أن يخرج بضربات الجزاء.

وكان هبوط المبرة موسم 1993 – 1994 إلى الدرجة الرابعة درساً بليغاً أفاد منه الفريق. فكانت الانطلاقة الجديدة من خلال الفوز ببطولة الدرجة الرابعة موسم 1994 – 1995م ومن ثم العودة للدرجة الثالثة ومن بعدها الصعود للدرجة الثانية قبل أن ينجح في الصعود للدرجة الثانية قبل أن ينجح في الصعود لدوري الأضواء وكانت آخر مباراة خاضها في الدرجة الثانية أمام شباب الخيام وفاز فيها بهدف لجمال خليفة في الدقيقة 64 في ضربة جزاء على ملعب برج حمود. وقد انطلق هذا الفريق من الدرجات الدنيا إلى مصاف أندية الدرجة الأولى بكرة القدم التي تجمع نخبة الأندية اللبنانية العريقة وذلك بدءاً من الموسم 2002-2003م.

وقد تميز المبرة في الأوساط الكروية بأنه يرفده خزان مواهب من مختلف أنحاء الوطن، من خلال انتشار مؤسسات المبرات التي تشكل الروافد الأساسية للنادي في كل أنحاء لبنان من الجنوب إلى بيروت والبقاع والشمال وغيرها من المناطق.