يضم مختبر العلوم قسمين:
• قسم العلوم الطبيعية والكيمياء حيث يقوم الطلاب بأنفسهم بالتجارب العلمية من تشريح وتحاليل مخبرية وتطبيق بعض التفاعلات الكيميائية واكتشاف وجود بعض العناصر... وذلك تحت إشراف اختصاصيين من أهل الخبرة.
• قسم الفيزياء، والذي يحوي مختلف الأجهزة في مجالات الميكانيك والكهرباء والبصريات... إضافة إلى مشروع "فيفا" الذي يحصل التلاميذ بواسطته، بعد إنجاز تجاربهم، على رسوم بيانية للنتائج التي توصلوا إليها، وذلك من خلال أجهزة الكومبيوتر، ما يمكّنهم من تحليلها بشكل أوضح.
